Obdobje po samosvojitvi
1990
Soške elektrarne so po 25 letih prenos električne energije prenesle na novo ustanovljeno podjetje Elektro-Slovenije d.o.o. (ELES). Osnovna in edina dejavnost Soških elektrarn je postala proizvodnja električne energije.
1991
Na Podbrdu na Mohorčevem potoku je bila zgrajena elektrarna Bača.
1993
Na potoku Prošček je začela obratovati elektrarna Knežke Ravne 2.
1995
Na reki Tolminki se je zaključila gradnja elektrarne Tolmin. Soške elektrarne so v sodelovanju s Tolminsko ribiško družino ob elektrarni zgradile ribogojnico endemičnih soških postrvi in s tem poskrbele za njeno ohranjanje. Voda Tolminke je še danes v prvi vrsti namenjena ribogojnici in šele nato pridobivanju električne energije.
1996
Začeli sta se gradnja novih elektrarn Doblar 2 in Plave 2 ter obnova starih elektrarn Doblar 1 in Plave 1. Pri gradnji novih elektrarn so prvič v Sloveniji uporabili tehnologijo gradnje dovodnih predorov (TBC), ki je omogočila izjemno hitro izvedbo zahtevnih del.